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本实用新型提供了一种时钟系统及计数器.所述时钟系统包括控制系统和外部时钟装置;所述控制系统包括:控制器和第一振荡源;所述控制器用于根据所述第一振荡源输出的振荡信号生成第一时钟信号;所述外部时钟装置用于生成第二时钟信号,并将所述第二时钟信号输出至所述控制器;其中所述第二时钟信号的精度大于所述第一时钟信号的精度.可见本实用新型通过精度更高的第二时钟信号提高了执行任务时的定时精确性,还通过第一时钟信号保证了一般任务的执行.此外本实用新型在生成精度更高的第二时钟信号时不再依赖于控制器,因此即使控制器处理能力较差,也不会影响提高时钟的精度,从而实现了采用处理能力较低的控制器即能提高时钟的精度.