编码器和位置开关（行程开关）在定义、功能和应用上存在一些明显的区别。

首先，编码器是一种计算机程序或设备，其主要作用是将输入数据转换为特定格式的编码。编码器可以将一种形式的数据转化为另一种形式，以便于传输、存储、处理和解码。它通常用于音频和视频压缩、数据加密、错误检测和纠正等多种应用。在计算机和自动化控制系统中，编码器主要用于将信息从一种表达形式转换为另一种形式，如将文字信息编码为二进制形式，音频编码为数字信号，视频编码为一系列图像等。编码器的目标是在尽可能减少数据量的同时，保持数据的质量。

而位置开关（行程开关），是一种常用的小电流主令电器。它利用生产机械运动部件的碰撞使其触头动作来实现接通或分断控制电路，达到一定的控制目的。位置开关主要用于限制机械运动的位置或行程，使运动机械按一定位置或行程自动停止、反向运动、变速运动或自动往返运动等。位置开关在电气控制系统中，作用是实现顺序控制、定位控制和位置状态的检测，以及控制机械设备的行程及限位保护。

从功能上来看，编码器和位置开关都涉及位置信息的处理，但方式有所不同。编码器主要是将物理位置信息转换为数字信息，以便于计算机处理和存储；而位置开关则是通过检测机械运动部件的位置，来控制电路的接通或分断，实现位置控制或保护。

在应用上，编码器广泛应用于计算机通信、自动化控制和工业自动化等领域，用于数据转换、测量和控制等；而位置开关则主要用于各类机床、起重机械、电梯等设备的行程控制和限位保护。

综上所述，编码器和位置开关在定义、功能和应用上存在明显的区别。编码器主要关注数据的转换和处理，而位置开关则更侧重于实现位置控制和保护。